ABI 310型基因分析儀,DNA測(cè)序儀
隨著分子生物技術(shù)在人類基因組測(cè)序、人類遺傳病、傳染病和癌證的臨床診斷、生物工程藥物的篩選、動(dòng)植物雜交育種、動(dòng)物親子鑒定和性別鑒定、植物疾病診斷、法醫(yī)鑒定等方面的應(yīng)用,科學(xué)工作者越來(lái)越需要一種自動(dòng)化程度更高,應(yīng)用更廣泛,價(jià)格更為適中的遺傳分析儀,為滿足這種需要,美國(guó)Applied Biosystems公司于1995年推出了310型全自動(dòng)遺傳分析儀,310型不僅具有DNA測(cè)序、PCR片段大小分析和定量分析功能,而且實(shí)現(xiàn)了全部操作自動(dòng)化,包括自動(dòng)灌膠、自動(dòng)進(jìn)樣、自動(dòng)數(shù)據(jù)收集分析。310型全自動(dòng)遺傳分析儀采用毛細(xì)管電泳技術(shù)取代傳統(tǒng)的聚丙烯酰胺凝膠平板電泳進(jìn)行DNA測(cè)序分析,繁鎖的灌膠和上樣過(guò)程全部由泵和自動(dòng)進(jìn)樣器完成。每次測(cè)序之前,只需把樣品放到自動(dòng)進(jìn)樣品的樣品盤中,設(shè)置電泳參數(shù)、數(shù)據(jù)收集和分析參數(shù)即可。Applied Biosystmes公司提供經(jīng)多年潛心研究的專利產(chǎn)品-凝膠高分子聚合物,包括DNA測(cè)序膠和GeneScan膠,凝膠顆?讖骄唬苊饬伺淠z條件不一致對(duì)測(cè)序精度的影響。此外,Applied Biosystems公司還提供各種試劑盒,應(yīng)用軟件和全球性的技術(shù)支持。 ABI 310型全自動(dòng)DNA測(cè)序儀具有以下特點(diǎn): l 應(yīng)用廣泛測(cè)序及片段分析的應(yīng)用包括未知序列測(cè)定、已知序列的比較測(cè)序、雜合子分析(Heterozygote Detection)、SSCP分析(SSCP Analysis)、微衛(wèi)星序列分析(Microsatellite Analysis)、長(zhǎng)片段PCR(分析Long PCR)等
自動(dòng)化程度高自動(dòng)灌膠:在分析一個(gè)樣品前,泵自動(dòng)沖掉上一次分析用過(guò)的膠,灌入新膠。自動(dòng)取樣:把待測(cè)樣品放到自動(dòng)進(jìn)樣器的樣品盤中,由計(jì)算機(jī)程序控制自動(dòng)進(jìn)樣。自動(dòng)進(jìn)樣器有48孔和96孔兩種樣品盤,其中96孔樣品盤與本公司9600型PCR儀的樣品盤一致,所以經(jīng)PCR循環(huán)測(cè)序反應(yīng)的樣品可直接放到310測(cè)序儀中測(cè)序,此外特殊設(shè)計(jì)的樣品蓋可防止蒸發(fā)。
多色熒光毛細(xì)管測(cè)序技術(shù):由于采用專利四色熒光標(biāo)記技術(shù),使四個(gè)測(cè)序反應(yīng)產(chǎn)物可以在一根毛細(xì)管內(nèi)電泳,使毛細(xì)管測(cè)序成為可能,同時(shí)也大大提高了測(cè)序精度,即降低了同位素測(cè)序因泳道間遷移率差異對(duì)精度的影響。而且與377型遺傳分析儀一樣,310型遺傳分析儀也采用CCD攝像機(jī)作為檢測(cè)器,使每個(gè)樣品分析時(shí)間僅為2.5小時(shí)。
全自動(dòng)電腦控制:只需把測(cè)序樣品放到自動(dòng)進(jìn)器樣品盤中,輸入樣品信息,如:進(jìn)樣次序、進(jìn)樣時(shí)間和電壓,和數(shù)據(jù)分析模式,如:SSCP、微衛(wèi)星序列、VNTRS、DNA序列分析等模式,其余的工作,如:灌膠、進(jìn)樣、電泳、檢測(cè)、數(shù)據(jù)分析全部由電腦控制進(jìn)行。此外電腦還控制電泳的溫度、電壓、時(shí)間,同步監(jiān)測(cè)電泳的情況,在分析上一個(gè)樣品數(shù)據(jù)的同時(shí)還可以收集下一個(gè)樣品的數(shù)據(jù)。
豐富的應(yīng)用試劑盒及軟件Applied Biosystems公司提供多種應(yīng)用試劑盒及應(yīng)用軟件,如用于親子鑒定和個(gè)體識(shí)別的 Profiler Plus, Cofiler, SGM plus試劑盒,用于真菌鑒定分型的D2 rRNA測(cè)序試劑盒,用于器官移植配型分析的HLA基因測(cè)序試劑盒,用于細(xì)菌鑒定分型的16s rRNA測(cè)序試劑盒,用于愛滋病毒突變檢測(cè)及新藥研發(fā)的HIV Genotyping試劑盒,用于脆性X檢測(cè)的Fragile X試劑盒,用于單核苷酸多態(tài)性分析的SNapshot試劑盒,用于動(dòng)植物育種、基因組作圖及差異顯示的AFLP試劑盒等,廣泛應(yīng)用于人類、動(dòng)植物、微生物等各項(xiàng)研究領(lǐng)域。性能指標(biāo):
310型遺傳分析儀性能表
應(yīng)用舉例 | 分離膠 | 毛細(xì)管 | 電泳時(shí)間及溫度 | 分辨大小 | 24小時(shí)產(chǎn)率 | |
標(biāo)準(zhǔn)測(cè)序 | DNA測(cè)序 | POP-6 | 內(nèi)徑50mm 長(zhǎng)度61cm | 2.75 hr 50°C | 600Nt | 5220Nt |
快速測(cè)序 | 比較測(cè)序 | POP-6 | 內(nèi)徑50mm 長(zhǎng)度47cm | 60 min 50°C | 400Nt | 9120Nt |
片段大小分析 | 微衛(wèi)星分析 差異顯示AFLPs | POP-4 | 內(nèi)徑50mm 長(zhǎng)度47cm | 30 min 60°C | 350Nt | 720個(gè)片段 |
VNTRs | 3.0%片段分析膠 | 內(nèi)徑50mm 長(zhǎng)度47cm | 21 min 30°C | 350Nt | 204個(gè)樣品 | |
突變檢測(cè) | SSCP | 3.0%片段分析 10%甘油 | 內(nèi)徑50mm 長(zhǎng)度47cm | 20 min 30°C | 300Nt | 72個(gè)樣品 |
定量 | RT-PCR | 3.0%片段 分析膠 | 內(nèi)徑50mm 長(zhǎng)度47cm | 22 min 30°C | 1000Nt | 195個(gè)樣品 |
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